お知らせ
感染症情報
研究・検査・病原体管理
サーベイランス
刊行・マニュアル・基準
ここでは、学術雑誌に掲載された感染研の研究者の論文や報道等のあった研究成果の要約を公開することで、感染研が行っている研究業務を紹介していきます。
- 詳細
- カテゴリ: ウイルス学
- 参照数: 30715
この記事の評価: 5 / 5
Efficient detection of SARS-CoV-2 RNA in the solid fraction of wastewater.
Kouichi Kitamura, Kenji Sadamasu, Masamichi Muramatsu, Hiromu Yoshida.
Science of The Total Environment, Article 144587
新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）感染状況を把握する上で、環境サーベイランスの活用が検討されています。このウイルスが一定割合で感染者の糞便中に存在し下水でも検出されることが報告されていますが、その最適な手法はまだ確立されていません。
- 詳細
- カテゴリ: ウイルス学
- 参照数: 17322
この記事の評価: 5 / 5
Human sapovirus propagation in human cell lines supplemented with bile acids.
Hirotaka Takagi, Tomoichiro Oka, Takashi Shimoike, Hiroyuki Saito, Takayuki Kobayashi, Tomoko Takahashi, Chika Tatsumi, Michiyo Kataoka, Qiuhong Wang, Linda J. Saif, Mamoru Noda.
Proc. Nat. Acad. Sci. USA, PNAS first published November 30, 2020;
ヒトサポウイルスはノロウイルス同様、下痢嘔吐原因ウイルスのひとつで、
広い年齢層で感染・発症し、再感染や食中毒を含む集団感染事例も報告されています。1970年代の発見以降、このウイルスの培養や実験動物を用いた増殖系は存在せず、不活性化条件検討や感染・増殖のメカニズムはわからないままでした。今回、国立感染症研究所、地方衛生研究所、国立医薬品食品衛生研究所、及び米国オハイオ州立大学との共同研究により、ヒトサポウイルスが胆汁酸存在下、ヒト由来細胞株で増殖することを見出し、ウイルス分離とその継代培養にも成功しました。ヒトサポウイルスが加熱や紫外線の処理に対し、一定の抵抗性を有することもわかりました。
- 詳細
- カテゴリ: 分子生物学
- 参照数: 21253
この記事の評価: 5 / 5
Identification of characteristic genomic markers in human hepatoma HuH-7 and Huh7.5.1-8 cell lines,
Kawamoto M, Yamaji T, Saito K, Shirasago Y, Satomura K, Endo T, Fukasawa M, Hanada K, and Osada N.
Frontier in Genetics, 111, Article 546106, 2020
研究に使用している細胞が意図したものであるのかを定期的にチェックする作業は楽ではありません。しかし、それを怠り、別の細胞を使用していたことが後から発覚すると、得たデータは使いものにならず、研究者自身の信用も失うという悪夢を招きます。
- 詳細
- カテゴリ: ウイルス学
- 参照数: 16696
この記事の評価: 5 / 5
HTLV-1 targets human placental trophoblasts in seropositive pregnant women.
Kenta Tezuka, Naoki Fuchi, Kazu Okuma, Takashi Tsukiyama, Shoko Miura, Yuri Hasegawa, Ai Nagata, Nahoko Komatsu, Hiroo Hasegawa, Daisuke Sasaki, Eita Sasaki, Takuo Mizukami, Madoka Kuramitsu, Sahoko Matsuoka, Katsunori Yanagihara, Kiyonori Miura, Isao Hamaguchi.
J Clin Invest. 2020 Oct 19:135525. doi: 10.1172/JCI135525.
ヒトT細胞白血病ウイルス1型 (HTLV-1) は重篤な成人T細胞白血病 (ATL) やHTLV-1関連脊髄症 (HAM) の原因ウイルスである。HTLV-1は主に感染者 (キャリア) の母乳を介して児に感染することが知られており、人工栄養法の選択や母乳栄養法を工夫することによって母子感染を高いレベルで制御可能であることが明らかにされている。その一方で完全な人工栄養法を選択した児の一部にも感染が認められることから、母乳以外の感染経路の存在が示唆されていたが長い間その詳細は不明であった。
- 詳細
- カテゴリ: 細菌学
- 参照数: 16605
この記事の評価: 5 / 5
Immunodominant proteins P1 and P40/P90 from human pathogen Mycoplasma pneumoniae.
David Vizarraga, Akihiro Kawamoto, U. Matsumoto, Ramiro Illanes, Rosa Pérez-Luque, Jesús Martín, Rocco Mazzolini, Paula Bierge, Oscar Q. Pich, Mateu Espasa, Isabel Sanfeliu, Juliana Esperalba, Miguel Fernández-Huerta, Margot P. Scheffer, Jaume Pinyol, Achilleas S. Frangakis, Maria Lluch-Senar, Shigetarou Mori, Keigo Shibayama, Tsuyoshi Kenri, Takayuki Kato, Keiichi Namba, Ignacio Fita, Makoto Miyata & David Aparicio
Nature Communications 11, Article number: 5188 (2020)
P1タンパク質複合体はP1とP40/P90が2分子ずつの4量体構造で、インフルエンザウイルスと同様に細胞表面のシアリルオリゴ糖（SAα2,6GalおよびSAα2,3Gal）に結合する。今回、クライオ電顕法とX線結晶構造解析でP1とP40/P90の分子構造を1.9Å、2.9Åの解像度で解明した。
- 詳細
- カテゴリ: 検査法
- 参照数: 26269
この記事の評価: 5 / 5
Establishment of a novel diagnostic test algorithm for human T-cell leukemia virus type 1 infection with line immunoassay replacement of western blotting: a collaborative study for performance evaluation of diagnostic assays in Japan.
Okuma K, Kuramitsu M, Niwa T, Taniguchi T, Masaki Y, Ueda G, Matsumoto C, Sobata R, Sagara Y, Nakamura H, Satake M, Miura K, Fuchi N, Masuzaki H, Okayama A, Umeki K, Yamano Y, Sato T, Iwanaga M, Uchimaru K, Nakashima M, Utsunomiya A, Kubota R, Ishitsuka K, Hasegawa H, Sasaki D, Koh KR, Taki M, Nosaka K, Ogata M, Naruse I, Kaneko N, Okajima S, Tezuka K, Ikebe E, Matsuoka S, Itabashi K, Saito S, Watanabe T, Hamaguchi I.
Retrovirology. 2020 Aug 24;17(1):26.
現在ヒトT細胞白血病ウイルス１型(HTLV-1)感染の診断では、HTLV-1 抗体の一次検査陽性例に確認検査としてウエスタンブロット(WB)法を実施しているが、しばしば判定保留となる課題があった。本研究でWB法の代替法としてラインブロット(LIA)法の性能を評価したところ、判定保留例の大半を判定できることが分かった。
- 詳細
- カテゴリ: ウイルス学
- 参照数: 19321
この記事の評価: 5 / 5
MARCH8 inhibits viral infection by two different mechanisms.
Yanzhao Zhang, Takuya Tada, Seiya Ozono, Satoshi Kishigami, Hideaki Fujita, and Kenzo Tokunaga.
我々が以前報告した抗ウイルス宿主因子MARCH8（Nature Medicine, 21:1502-7. 2015）は、ウイルス産生細胞において、水胞性口炎ウイルスG（VSV-G）およびHIV-1エンベロープ（Env）のウイルス粒子への取込みを阻害して産生ウイルスの感染性を低下させるが、その詳細な分子抑制機構は不明であった。
- 詳細
- カテゴリ: ウイルス学
- 参照数: 17658
この記事の評価: 5 / 5
Super-rapid quantitation of the production of HIV-1 harboring a luminescent peptide tag.
Seiya Ozono, Yanzhao Zhang, Minoru Tobiume, Satoshi Kishigami, and Kenzo Tokunaga.
J. Biol. Chem. (2020) Jul 20:jbc.RA120.013887.
HIVおよびレンチウイルスベクターを用いる研究において、ウイルス定量には一般的に市販のELISAキットを使用するが、コスト的・所要時間的に大きな負担がかかる。これを解決すべく、近年開発された発光型ペプチドタグHiBiTをインテグラーゼのC末端に付加した完全長HIV-1プロウイルスDNAまたはレンチウイルスベクターを構築した。
- 詳細
- カテゴリ: 細菌学
- 参照数: 24270
この記事の評価: 5 / 5
Periodic genotype shifts in clinically prevalent Mycoplasma pneumoniae strains in Japan.
Kenri T, Suzuki M, Sekizuka T, Ohya H, Oda Y, Yamazaki T, Fujii H, Hashimoto T, Nakajima H, Katsukawa C, Kuroda M, Shibayama K
Front. Cell. Infect. Microbiol., 06 August 2020
肺炎マイコプラズマ（Mp）によるマイコプラズマ肺炎は若年齢層に多く、発生頻度の高い市中肺炎である。今回、過去40年間のMp分離株の遺伝子型、マクロライド耐性の調査結果を集計した。
- 詳細
- カテゴリ: ゲノム研究
- 参照数: 248388
この記事の評価: 5 / 5
国立感染症研究所病原体ゲノム解析研究センター
新型コロナウイルスSARS-CoV-2のゲノム上にランダムに発生する変異箇所の足跡をトレースすることにより、感染リンクの過去を遡り積極的疫学調査を支援している。この調査により、これまでの経過は以下の様に説明できると考えている。中国発から地域固有の感染クラスターが発生し、“中国、湖北省、武漢” をキーワードに蓋然性の高い感染者・濃厚接触者をいち早く探知して抑え込むことができた。しかしながら、３月中旬から全国各地で欧州系統の同時多発流入により“感染リンク不明” の孤発例が検出されはじめた。数週間のうちに全国各地へ拡散して地域固有のクラスターが国内を侵食し、３−４月の感染拡大へ繋がったと考えられる。現場対策の尽力により一旦は収束の兆しを見せたが、６月の経済再開を契機に “若者を中心にした軽症（もしくは無症候）患者” が密かにつないだ感染リンクがここにきて一気に顕在化したものと推察される。隠れた感染リンクをいち早く探知するためにも、聞き取りによる実地疫学調査に加え、ゲノム分子疫学調査による拡散範囲を特定し、そのクラスター要因の特徴を示すことは今後の新型コロナ対策にとって必須だと考えている。
一方、本調査におけるゲノム情報は “鑑識” としての役割を担っているに過ぎず、聞き取り調査等の疫学情報無しでは成立しない。あくまで疫学調査を支援するひとつの支援材料であることを予めご留意いただきたい。塩基変異を足取りに “ゲノム情報を基礎にしたクラスター認定” を実施しているが、これは地域名や業種を特定して名指しするものではなく、あくまで患者としての成り立ちを “ウイルス分子疫学” として束ねてその共通因子を探る調査法である。現状、収束の見込みはあっても終息までにはさらなる時間を要すると思われる。今後、将来発生するクラスターを最小限に抑え込むためにも、ゲノム情報にてクラスター発生に至る要因を特定し、地方自治体への迅速な情報還元と効果的な感染症対策の構築を図っていく。
